刘惠琴表示，清华研究生教育研究中心致力于成为全球卓越的研究生教育研究机构，主要任务包括：开展研究生教育基本理论研究、战略规划与政策研究、高层次创新型人才培养模式研究以及研究生教育国际比较研究。
清华副校长杨斌希望该中心为国家及省市研究生教育领域的重大战略部署和政策制定提供有力的学术支撑；为清华研究生教育改革与发展提供理论支持和实践指导，提炼拔尖创新型人才成长规律；牵头建立全球研究生教育研究网络，为中国问题提供国际经验，为全球研究生教育改革贡献中国方案。
教育部学位管理与研究生教育司司长洪大用表示，有条件的高校成立专门机构加强研究生教育研究，事关当前和长远研究生教育的改革发展，事关研究生教育社会功能的发挥。他强调，该中心应“跳出教育看教育、立足全局看教育、放眼长远看教育”，发挥清华优势，协同国内外资源，组织开展全面、深入、科学、系统的研究，不断把握研究生教育的本质和发展规律，不断创新研究生教育理论成果和实践经验，为促进我国研究生教育高质量发展、建设研究生教育强国贡献力量。
中国学位与研究生教育学会副会长郭新立建议该中心坚持探索研究生教育学基本规律，持续加强研究生教育学的学科体系、教材体系、课程体系建设，提升品牌性成果的质量和影响力，并主动加强与学会的通力合作，汇聚发展合力，建设研究生教育的学术共同体。
教育部原副部长、中国工程院院士赵沁平结合新阶段研究生教育发展面临的挑战，对该中心提出了三点建议：要坚持引进和汇聚人才，积极吸纳专职、兼职研究人员，产出创新型科研成果；要填补研究生教育研究无人区，抓住研究生教育整体发展的着力点，从研究生培养的质量、规模、结构、效益四个维度出发开展研究工作，坚持探索研究生培养规律，对研究生不仅应因材施教，也要考虑“因愿施教”；要注重以学科交叉开展研究，实现与经济学、管理学等多学科的交叉融合，丰富研究生教育领域的研究。
