当年中国医科大学没有与东北大学合并的原因有多种。首先，两所学校在学科领域、办学特色和发展方向等方面存在一定的差异，可能合并后会产生一些管理和教学上的难题。其次，合并需要双方共同意愿和协商，如果双方没有达成一致的意见，就无法实现合并。
此外，还有一些其他因素可能影响两校的合并。例如，合并后的学校领导班子和管理体系需要重新组建和调整，这涉及到人事和权力等方面的考虑。同时，两校合并也需要得到教育部等相关部门的批准和支持，如果相关政策或法规不允许或不支持合并，也会影响两校的合并决策。
2000年的时候，中国医科大学也是部属高校，所以学校层次还是比较高的。但是如今来看，当年选择和985合并的医科大学发展得更好一些，而中国医科大学则发展相对缓慢一些。
另外由于医科大学地域性很强，所以合并之后影响力还是局限于东北地区。如今的东北地区人才流失比较严重，因此报考中国医科大学的考生并不算太多。
综上所述，中国医科大学没有与东北大学合并可能是出于多种因素的考虑，包括学科差异、办学特色、发展方向、双方意愿、管理难题、政策法规等等。虽然合并可以带来一些优势和效益，但也需要综合考虑各种因素和利弊得失，做出符合双方利益和未来发展的决策。
